《超市特工》的主人公查克·巴托斯基是买又多超市的电器修理工。十年前，他曾是斯坦福大学的高材生。大二那年，他因为偷了一张卷子，被室友布莱斯·拉尔金陷害，被学校开除。拉金甚至带走了查克的女朋友。这一系列的打击让查克再也没有女朋友，梦想也基本被放弃了。拉金实际上是一名特工，但他背叛了组织，窃取了所有的国家机密。在逃跑的过程中，他知道自己逃不掉了，就把所有的信息发给了查克，被击毙。查克打开邮件后，奇妙的事情发生了。他的大脑实际上保存了所有的信息。从此以后，只要查克看到与信息相同的图片，他就会像电脑搜索功能一样迅速地立即找到相应的信息。这种特殊功能使得查克成为国土安全部和中央情报局的头号保护对象，各部门都派出特工保护查克。查克深深地爱上了莎拉·沃克，一个假装是他女朋友的中情局特工。中情局和国家局开始构建新的机密数据库开关，希望摆脱对查克的依赖和保护，查克希望尽快摆脱这种充满谎言的生活，和心爱的女孩莎拉开始真正的情人生活。但是现实和梦想总是有差距的。查克的梦想能实现吗？这时，拉金再次出现。是不是还有什么隐情？......